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文献导读|Nature Medicine:Z6·尊龙凯时助力PhIP-seq技术在复杂感染性疾病病因学研究中的应用

发布时间:2025-03-20   信息来源:尊龙凯时官方编辑

2019年11月,来自加利福尼亚大学旧金山分校的研究团队在《Nature Medicine》上发表了一项关于肠道病毒感染引发儿童急性无力脊髓炎(AFM)的研究。这项研究利用高通量的PhIP-seq技术,结合病毒组抗原库,检测了42名确诊AFM的儿童和58名其他神经系统疾病儿童的脑脊液样本,旨在筛选与AFM病因学相关的病毒特异性抗体。

文献导读|Nature Medicine:Z6·尊龙凯时助力PhIP-seq技术在复杂感染性疾病病因学研究中的应用

研究结果显示,肠道病毒抗体在AFM患者组中显著富集,随后通过ELISA实验验证了这一发现。这一研究暗示肠道病毒感染可能是大多数AFM病例的潜在病因。这为未来肠道病毒脑脊液抗体测定方法的快速开发奠定了基础,从而助力临床对肠道病毒相关AFM的有效诊断和治疗。

研究背景

急性无力脊髓炎(AFM)自2012年首次在美国被识别以来,已经有超过500名儿童确诊。此病通常在与肠道病毒EV-D68型和EV-A71型的爆发同期发生,但其病因仍未得到明确确认。研究人员发现,在少于50%的患者样本中可以检测到肠道病毒,而在AFM儿童脑脊液中的核酸检测率更低,仅为约2%。这使得研究者担心可能存在尚未识别的病原体或副感染性的免疫反应会导致AFM的发生。

研究方法与结果

为了探明AFM的发病机制,研究人员利用PhIP-seq技术解析AFM患儿及对照组脑脊液中的病毒抗体谱。这种技术能够高通量地检测数百种病毒的特异性抗体,最终通过ELISA实验对结果进行了验证。

主要研究结果如下:

结果一:PhIP-seq技术全面分析了AFM组儿童的病毒抗体反应,发现小RNA病毒科中的肠病毒属抗体反应在AFM组中显著高于对照组。

结果二:数据分析表明,免疫原性抗原肽段来源于肠道病毒基因组的蛋白质,且可以识别已知的线性表位序列以及新发现的线性结合表位。

结果三:使用EV病毒VP1蛋白进行ELISA验证,结果显示AFM患儿组的脑脊液样本中大多数能够检测到EV信号,结果与PhIP-seq检测结果高度一致。

PhIP-seq技术介绍

噬菌体免疫沉淀测序(PhIP-seq)技术是一种高通量抗体谱检测工具,结合了噬菌体展示多肽库、抗体免疫沉淀及高通量测序技术。这项技术可以检测数十万种抗原的抗体,全面描绘血清抗体谱,为免疫力相关的研究提供有力支持。

在操作过程中,该技术选择目标抗原数据库,切分成重叠区的肽段,并合成对应的DNA寡核苷酸,最终形成多肽抗原库。通过孵育样本血清,随后富集特异性抗体,最后进行PCR扩增和测序,以解析抗体表位谱,进而研究相关疾病的特征。

公司介绍

上海抗码芯瑞生物科技有限公司(简称“抗码芯瑞”)由上海交通大学知名教授领衔创办,专注于蛋白组和抗体组领域的研究已有20余年。公司致力于前沿抗体组学技术方法的开发和成果转化,建立了PhIP-seq技术平台,并定制开发六大抗原组库,提供个性化抗原建库服务。

抗码芯瑞通过基于PhIP-seq平台的高通量筛选、数据分析及后续验证等技术服务,为抗体组学研究提供全面解决方案。

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